El inicio de operaciones del Nuevo Aeropuerto, previsto para el 12 de octubre, constituye un desafío de transición que involucra a más de 250 entidades que operan en el Mariscal Sucre actualmente. Para esto se constituyó una Comisión de Transición con varios grupos de trabajo que incluyen a las aerolíneas, agencias de gobierno, Municipio de Quito, operadores comerciales, proveedores de servicios, carga y demás actores del quehacer aeroportuario.
Quiport contrató la asesoría del Aeropuerto de Munich por su experiencia en la preparación operativa y transición de más de 25 aeropuertos del mundo. Esta institución alemána desarrolló el Plan de Transferencia y Activación Aeroportuaria (ORAT por sus siglas en inglés) que actualmente se ejecuta en el Aeropuerto Internacional de Viena y el Aeropuerto Internacional Brandemburgo de Berlín, entre otros.
DHL Global Forwarding, empresa con una vasta experiencia en proyectos industriales y transiciones aeroportuarias, se encargará de la reubicación y traslado de todo el equipo del Mariscal Sucre al NAIQ. En los meses previos a la apertura oficial se ejecutará un programa de familiarización integral con las instalaciones del NAIQ para todo el personal del aeropuerto.